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    Crean una herramienta que detecta nuevas variantes de covid hasta 14 días antes

    Se llama Freyja y es capaz de determinar con precisión cuántas mutaciones del SARS-CoV-2 circulan entre la población.

    09 de julio 2022, 05:44hs
    Freyja determina con precisión cuántas variantes del SARS-CoV-2 circulan entre la población. (Foto: Adobe Stock)
    Freyja determina con precisión cuántas variantes del SARS-CoV-2 circulan entre la población. (Foto: Adobe Stock)
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    Un nuevo hallazgo cambiaría la detección de la incidencia del covid en el mundo. Un grupo de científicos de Scripps Research y de la Universidad de California en San Diego (Estados Unidos) -en colaboración con la alianza San Diego Epidemiology and Research for COVID Health- creó una herramienta que detecta nuevas variantes de covid hasta 14 días antes.

    Este nuevo método, llamado Freyja, es capaz de determinar con precisión cuántas variantes del SARS-CoV-2 circulan entre la población e identificar las nuevas mutaciones hasta dos semanas antes que las pruebas clínicas convencionales.

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    De acuerdo con la investigación, publicada en la revista Nature, esta herramienta detectó la variante Ómicron en las aguas residuales de San Diego, 11 días antes de que se notificara clínicamente por primera vez.

    Freyja ya está siendo utilizada por muchos laboratorios de salud pública y por los servicios de vigilancia que buscan nuevas variantes del virus.

    La nueva herramienta logra detectar las variantes de covid hasta 14 días antes que las pruebas convencionales. (Foto: Adobe Stock)
    La nueva herramienta logra detectar las variantes de covid hasta 14 días antes que las pruebas convencionales. (Foto: Adobe Stock)

    Kristian Andersen, inmunólogo del Scripps Research y autor principal del estudio, señaló: “En muchos sitios, la vigilancia clínica estándar de las nuevas variantes no solo es lenta, sino también extremadamente cara, pero con esta nueva herramienta se puede tomar una pequeña muestra de aguas residuales y, básicamente, hacer un perfil de toda la ciudad”.

    Para hacer el proyecto, el laboratorio del microbiólogo de la UC San Diego Rob Knight desplegó 131 automuestreadores de aguas residuales que recogieron muestras de 343 edificios del campus de la Universidad de California y de 17 escuelas públicas de cuatro distritos escolares de San Diego. Después de un año, tenían más de 20 mil muestras de aguas residuales en las que el laboratorio Andersen asumió el reto de cuantificar las variantes virales que había a partir de los datos de secuenciación.

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    Joshua Levy, investigador posdoctoral de Scripps y coautor del artículo con Smruthi Karthikeyan de la UC San Diego, dijo: “Es un reto tomar todos estos pequeños trozos de virus que flotan en las aguas residuales y averiguar cuáles son de las diferentes variantes del virus”.

    ¿Cómo fue el estudio?

    Para el estudio, Levy desarrolló una biblioteca de códigos de barras que identifican las variantes del SARS-CoV-2, basándose en pequeños fragmentos de su ARN que son exclusivos de cada una de ellas. Luego, creó una nueva herramienta informática que contenía todos los códigos de barras y obtuvo como resultado Freyja, un programa fácil de usar y gratuito.

    Al respecto, comentó: “Si tenés un laboratorio que ya puede secuenciar una muestra de aguas residuales, estás listo: solo tenés que ejecutar este código y en otros 20 segundos habrás terminado”.

    Para testear la eficacia del hallazgo, los investigadores aplicaron Freyja a las muestras de aguas residuales y compararon los resultados con los datos clínicos recogidos en los alrededores de San Diego por SEARCH.

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    Descubrieron que la herramienta detectaba variantes del covid preocupantes (como Alfa, Delta y Ómicron), hasta 14 días antes de que se notificaran clínicamente.

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